1925年12月29日，孫文主義學(xué)會(huì )在廣東大學(xué)大操場(chǎng)舉行成立典禮。據1926年1月6日出版的《上海民國日報》記載，成立典禮當天，孫文主義學(xué)會(huì )在黃埔軍官學(xué)校教導團、國民革命軍各軍的代表，會(huì )同廣大、培正、執信女師、市師、市商、國民大學(xué)、女子體育等50余所院校的男女學(xué)生，廣東工商界代表，留學(xué)生代表以及各界群眾1萬(wàn)人參加。大會(huì )在中午12時(shí)開(kāi)始，主要內容有宣讀孫中山先生遺囑和各界代表演說(shuō)，黃埔軍校黨代表汪精衛到會(huì )并發(fā)表演說(shuō)等，會(huì )后還進(jìn)行了游行。

　　孫中山先生改組國民黨、實(shí)行“聯(lián)俄、聯(lián)共、扶助農工”三大政策后，使一批優(yōu)秀的中共黨員進(jìn)入國民黨，在此后不久創(chuàng )辦的黃埔軍校，也任用了一批中共黨員身份的教官，國共兩黨開(kāi)始了第一次合作。但自實(shí)行三大政策以來(lái)，謝持、張繼等一批身居國民黨高層的人物，一直對此持反對態(tài)度，在國民黨內部就出現左派和右派的斗爭，這種情況在黃埔軍校則表現為“中國青年軍人聯(lián)合會(huì )”與“孫文主義學(xué)會(huì )”的對立和斗爭。

　　中國青年軍人聯(lián)合會(huì )最早稱(chēng)“青年軍人代表會(huì )”。1924年8月，為平定商團叛亂，孫中山指示廖仲愷和蔣介石，命令黃埔軍校學(xué)生與各軍校取得聯(lián)系，組織青年軍人代表會(huì )。參加者除黃埔軍校師生外，還包括當時(shí)在廣州的滇軍干部學(xué)校、粵軍講武堂、軍政部講武堂、警衛軍講武堂、桂軍學(xué)校、大元帥府衛士隊、飛機掩護隊、航空學(xué)校、鐵甲車(chē)隊以及“永豐”“飛鷹”等軍艦的代表，會(huì )址設在國民黨中央黨部。

　　商團叛亂平定之后，各軍校學(xué)生感到“革命軍人有團結以挽救時(shí)局之必要”，而代表會(huì )還不是一個(gè)“實(shí)際的組織團體，偶有開(kāi)展的少量工作，也往往是有頭無(wú)尾，沒(méi)有連續性”，要求對代表會(huì )進(jìn)行改組，后經(jīng)報請黨代表廖仲愷和校長(cháng)蔣介石同意，代表會(huì )于1925年1月25日推舉蔣先云、曾擴情、賀衷寒等人負責，籌備成立中國青年軍人聯(lián)合會(huì )。中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成立之初，身為校長(cháng)的蔣介石表示贊成，并親自寫(xiě)了《組織發(fā)起中國青年軍人聯(lián)合會(huì )序言》，呼吁“廣大的青年軍人立即行動(dòng)起來(lái)，團結起來(lái)，在革命政府的旗幟之下，做中國革命的先鋒派”。軍校黨代表廖仲愷在經(jīng)費十分困難的情況下，還專(zhuān)門(mén)撥出500元作籌備會(huì )的經(jīng)費。

　　1925年2月1日，在廣東大學(xué)大操場(chǎng)舉行了中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成立大會(huì )，參加大會(huì )的各軍校學(xué)生2000多人，各界群眾3000多人。聯(lián)合會(huì )的主要成員多為黃埔軍校師生中的共產(chǎn)黨員，如蔣先云、李之龍、周逸群、徐向前、陳賡、王一飛、許繼慎、左權、陳啟科、李漢藩、楊其綱、張際春、余灑度、金佛莊、茅延楨、魯易、胡公冕、郭俊、唐同德、劉云、李永光等。聯(lián)合會(huì )名義上歸黃埔軍校黨代表領(lǐng)導，實(shí)際上由軍校政治部主任周恩來(lái)和中共黨支部領(lǐng)導。聯(lián)合會(huì )下設“血花劇社”，并辦有《中國軍人》《青年軍人》《中國青年軍人聯(lián)合會(huì )周刊》等刊物。聯(lián)合會(huì )以黃埔軍校為基地，還派人去北京、上海、天津、煙臺、開(kāi)封、洛陽(yáng)等地的軍隊中發(fā)展會(huì )員，建立組織，會(huì )員發(fā)展到2萬(wàn)多人。

　　據黃埔1期生曾擴情回憶，自中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成立后，國民黨一些上層人士“就斷定青年軍人聯(lián)合會(huì )這個(gè)組織不是一般青年軍人的聯(lián)合，而是作為發(fā)展共產(chǎn)黨組織的據點(diǎn)，從而決定采取以組織對付組織的行動(dòng)”。此后，中國青年軍人聯(lián)合會(huì )的黃埔學(xué)生和他們的反對者之間開(kāi)始對立，雙方經(jīng)常唇槍舌劍地辯論，“有時(shí)弄到無(wú)法上課，會(huì )議不歡而散，影響了軍校的團結和教育”。

　　不久，黃埔軍校中成立了一個(gè)以賀衷寒為主席的6人執行委員會(huì )，最初取名為“中山主義研究社”，后改名為孫文主義學(xué)會(huì )。關(guān)于學(xué)會(huì )名稱(chēng)，其主要領(lǐng)導、黃埔軍校教育長(cháng)王柏齡曾做出如下解釋?zhuān)骸氨砻嫔霞炔皇欠磳伯a(chǎn)黨，而又是研究我側的孫文主義，難道研究馬克思主義的，會(huì )來(lái)加入嗎？這樣就可以和馬克思主義者畫(huà)一道鴻溝，爾為爾，我為我，八仙過(guò)海，各顯神通?！?到軍校黨代表廖仲愷遇害前，孫文主義學(xué)會(huì )曾大力在軍校內進(jìn)行組織活動(dòng)。廖案發(fā)生后，黃埔學(xué)生軍曾占領(lǐng)了粵軍第一軍司令部，孫文主義學(xué)會(huì )成員以此作為會(huì )所，正式開(kāi)始辦公，并在學(xué)會(huì )內部呼蔣介石為“領(lǐng)袖”。在黃埔軍校中，孫文主義學(xué)會(huì )的成員有王柏齡、賀衷寒、繆斌、楊引之、冷欣、杜從戎、潘佑強、曾擴情、伍翔、酆悌、賈伯濤、胡靖安、余程萬(wàn)、李果、胡宗南、桂永清、蔣伏生、林振雄、徐桴、王文翰、童錫坤、張叔通，還有虎門(mén)要塞司令陳肇英，廣州市公安局局長(cháng)吳鐵城，海軍將領(lǐng)陳策、歐陽(yáng)格等人，“幕后操縱者是戴季陶”。1925年10月以前，孫文主義學(xué)會(huì )“會(huì )具正式登記者且達千余人，大多是黃埔軍官學(xué)校已畢業(yè)的學(xué)生在黨軍中任中、下級干部，或在校學(xué)生”。為了和中國青年軍人聯(lián)合會(huì )對抗，孫文主義學(xué)會(huì )還成立了一個(gè)“白花劇社”，發(fā)行《國民革命》《獨立旬刊》等刊物，并派人到上海、北京、漢口、洛陽(yáng)等地成立分會(huì )，會(huì )員發(fā)展到近萬(wàn)人。據王柏齡回憶，1926年3月，廣州孫文主義學(xué)會(huì )還和京、津、滬、寧、蕪湖以及日本等地的孫文主義學(xué)會(huì )進(jìn)行聯(lián)絡(luò )，試圖召開(kāi)“孫文主義學(xué)會(huì )全國代表大會(huì )”未果。

　　隨著(zhù)會(huì )員在黃埔軍校內逐漸增加，孫文主義學(xué)會(huì )和中國青年軍人聯(lián)合會(huì )的對抗更加激烈，一些參加孫文主義學(xué)會(huì )的黃埔師生公開(kāi)地對共產(chǎn)黨員及進(jìn)步學(xué)生進(jìn)行攻擊，經(jīng)常在軍校宿舍、飯堂、教室里發(fā)表攻擊共產(chǎn)黨、蘇聯(lián)的言論，因而引起中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成員的反擊，繼而引起規模更大的辯論和爭議，兩會(huì )成員之間也時(shí)有打架發(fā)生。孫文主義學(xué)會(huì )分子與共產(chǎn)黨人“常有磨擦，如繆斌、賀衷寒等與蔣先云、傅維鈺等幾乎是開(kāi)口就相罵，動(dòng)手就打架”。其中最“有名”的沖突事件有：1925年10月，第二次東征開(kāi)始前，黨軍在廣東大學(xué)舉行誓師大會(huì )，李之龍正代表中國青年軍人聯(lián)合會(huì )講話(huà)，賀衷寒突然帶人沖進(jìn)會(huì )場(chǎng)，雙方由言語(yǔ)沖突，最后演化成幾百人大打出手的群毆；還有一次，孫文主義學(xué)會(huì )分子潘佑強、楊引之兩人，在廣州中山大學(xué)內遇到青年軍人聯(lián)合會(huì )的負責師生，即辱罵不休，施以毒打，而他們自己也遭到了反擊，雙方都有人受傷。此次事件后，潘、楊兩人的“打手”之名，很快傳遍了廣州。

　　隨著(zhù)雙方斗爭的不斷升級，很多軍校中沒(méi)有加入中國青年軍人聯(lián)合會(huì )、孫文主義學(xué)會(huì )的師生也被卷入了雙方的沖突。據張治中回憶，他在上述兩會(huì )里并沒(méi)有組織關(guān)系，在兩派斗爭中也沒(méi)有隨聲附和。不過(guò)有一次，為了“調解雙方摩擦”，戴季陶和沈定一在黃埔軍校邀集大家開(kāi)了一個(gè)座談會(huì )。在會(huì )上，戴季陶被中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成員質(zhì)問(wèn)，幾乎“不得下臺”，張治中見(jiàn)狀，就上前打圓場(chǎng)為戴季陶解圍，結果當即引起中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成員的不滿(mǎn)；而孫文主義學(xué)會(huì )的人，把他說(shuō)成是“赤色分子”，讓張治中感到“困難、苦痛”。時(shí)任黃埔軍校潮汕分校行營(yíng)主任的王懋功，由于為人“圓滑”，和雙方關(guān)系都不錯，結果一些孫文主義學(xué)會(huì )成員就說(shuō)他“已經(jīng)加入共產(chǎn)黨”，而中國青年軍人聯(lián)合會(huì )成員則把他看成“一個(gè)老奸巨滑的官僚”。

　　后來(lái)，雙方的斗爭更發(fā)展到了前線(xiàn)部隊。據黃埔2期生王大文回憶，在第二次東征途中抵潮州時(shí)，他曾與胡啟儒等人公開(kāi)號召和鼓動(dòng)同學(xué)參加孫文主義學(xué)會(huì )，結果與青年軍人聯(lián)合會(huì )成員“就中國革命的前途問(wèn)題展開(kāi)過(guò)辯論，雙方都竭力爭取同學(xué)的支持，斗爭尖銳而激烈”。但“在周恩來(lái)的領(lǐng)導之下，以團結與斗爭相結合，尚沒(méi)有發(fā)生甚么大的問(wèn)題”。時(shí)任軍校入伍生部政治部主任的包惠僧也回憶，軍校黨代表汪精衛“對這些糾紛是一籌莫展”。為解決雙方糾紛，汪精衛曾表示希望從東征前線(xiàn)調回一些有影響力的人回來(lái)勸架。

　　兩派爭斗日漸激烈，讓蔣介石甚為擔憂(yōu)。蔣介石在孫文主義學(xué)會(huì )舉行成立典禮開(kāi)始前，曾公開(kāi)宣稱(chēng)中國青年軍人聯(lián)合會(huì )和孫文主義學(xué)會(huì )之間的斗爭“有違‘親愛(ài)精誠’的校訓”，在第二次東征結束后，他向參加東征的黃埔官兵談話(huà)表示：“近日本軍多有互相猜忌，彼此懷疑。既違反‘親愛(ài)精誠’之校訓，而團體精神渙散，終必黨國俱亡，使吾各人生無(wú)可歸之家，死無(wú)葬身之地矣。望我同志深自戒惕?！?他還在《黃埔軍官學(xué)校第三期同學(xué)錄序》中寫(xiě)道：“軍校是總理一線(xiàn)相傳之國民黨內共產(chǎn)與非共產(chǎn)二者凝聚而成之血統也……以本校今日之精神，如不發(fā)生內部之分裂……合國際帝國主義者之全力而莫能御也?！贝送?，他更召見(jiàn)青年軍人聯(lián)合會(huì )負責人蔣先云，“談?wù){和內部的事情”。12月28日，即孫文主義學(xué)會(huì )在廣東大學(xué)大操場(chǎng)舉行成立典禮的前一天，正在汕頭的蔣介石得知孫文主義學(xué)會(huì )準備在廣州舉行反共游行的消息后，還“漏夜嚴電阻止”。

　　到了1926年，蔣介石見(jiàn)“無(wú)法制止雙方的活動(dòng)”，為了加強控制，曾和軍校首腦制定出“兩會(huì )干部準互相加入”、“兩會(huì )均受蔣介石、汪精衛指導”、“團長(cháng)以上高級軍官，除黨代表外，不得加入兩會(huì )”、“兩會(huì )會(huì )員彼此有不諒解時(shí)，得請校長(cháng)及校黨代表解決之”等條款，并頒布執行。4月7日，蔣介石又發(fā)布了一個(gè)《取消黨內小組織令》，宣稱(chēng)：“本校為造就革命軍人之機關(guān)，所以全體官生應知如何努力研究學(xué)術(shù)，接受黨訓，始能期思想行動(dòng)之一致。近查校內各官生于校特別黨部所屬組織外，尚有其他組織，實(shí)與集體化、紀律化之旨相妨礙。自本令公布日起，除本校特別黨部各級組織應由黨部加意工作外，其余各級組織著(zhù)即一律自行取消，此后并不得再有各種組織發(fā)生。如稍有違犯，一經(jīng)查出，實(shí)行嚴重究辦，以維紀律。著(zhù)各級長(cháng)官?lài)佬懈嬲]，飭所屬一體知照遵行?！?/p>

　　據此命令，兩個(gè)組織同時(shí)解散，并另成立黃埔同學(xué)會(huì )，把黃埔學(xué)生和教職員的組織統一起來(lái)，由蔣介石直接領(lǐng)導。1926年4月10日，中國青年軍人聯(lián)合會(huì )首先發(fā)出解散通電，21日，孫文主義學(xué)會(huì )也發(fā)出了自動(dòng)解散宣言，于是，兩個(gè)對立的組織就此解散了。